上海市影像医学研究所（以下简称“影研所”）由复旦大学附属中山医院终身教授，著名放射学家，博士研究生导师周康荣教授发起，经复旦大学附属中山医院同意并出资，经上海市民政局和上海市科学技术委员会批准于2001年12月正式挂牌成立。属于民办非企业单位，挂靠复旦大学附属中山医院。法人代表为复旦大学附属中山医院院长，主管单位为上海市民政局和上海市科学技术委员会。影研所实行理事会领导下的所长负责制，接受复旦大学、复旦大学附属中山医院、上海市卫生健康委员会、上海市科学技术委员会和上海市人力资源和社会保障局的共同领导。影研所以复旦大学附属中山医院的5个医学影像相关学科，即放射诊断科、介入治疗科、超声科、核医学科及心脏超声科为主体，联合复旦大学其它附属医院的相关科室共同组成。是复旦大学研究生教育的独立招生单位。

目前影研所所长为张志勇教授，上海医科大学影像诊断专业博士研究生毕业。曾任上海申康医院发展中心副主任；复旦大学附属中山医院副院长，上海市公共卫生临床中心（复旦大学附属公共卫生临床中心）党委副书记、主任，复旦大学副校长；主任医生，医学博士，博士研究生导师。

经过二十余年的发展，在医疗，教育和科学研究等方面都取得了长足进步。影研所大型医疗设备无论在数量还是质量上，处于全国领先地位。放射诊断科配置了DR 16台；CT 21台，有320排CT和新一代双源CT；高场强MRI机12台，其中5T MRI 1台；另外还有1台大平板DSA机。介入治疗科拥有DSA机5台，其中大平板DSA机3台，专用于介入引导穿刺的黑白超声诊断仪和超色多普勒超声诊断仪各1台，用于肿瘤消融治疗的微波消融机1台。超声科拥有超声诊断仪51台，其中2台专门用于介入诊疗。核医学科拥有PET/CT 4台、PET/MRI 1台；SPECT/CT 3台，SPECT1台，心脏专用伽马相机和乳腺伽马相机各1台，甲状腺功能测定仪各1台。配备有固定靶的20MeV回旋加速器1台。心脏超声科配置了多功能彩色心脏超声检查仪25台，床旁便携式心脏超声检查仪2台。影研所承担了大型综合性医院繁重的临床医疗影像诊断与介入治疗工作，年诊治病例达200余万人次。

作为复旦大学研究生教育的重要组成部分，上海市影像医学研究所是一个独立的招生与培养单位，致力于培养具有强大学术能力和创新潜力的研究生。影研所现有34名博士和硕士研究生导师，为研究生提供了优质的指导和支持。迄今为止，所培养的115位毕业生，包括32位博士和82位硕士研究生，在国际期刊上发表前沿的研究成果。目前，影研所拥有52名在读研究生。上海市影像医学研究所致力于不断提升研究与教学质量，培养能够在影像医学领域做出重要贡献的未来学者和专业人士。

科学研究是影研所的核心任务，在上级各部门的支持下，在历任影研所领导的带领下，在全所导师的共同努力下，各学科发展百花齐放，百家争鸣，包括且不局限于以下方向：肝癌、小肝癌为核心的肿瘤影像诊断，包括胰腺癌、肾癌、肺癌、乳腺癌、胃癌和结直肠癌的早期诊断、综合治疗后疗效评判等。冠心病和各类心血管疾病的无创性影像诊断。早期肝纤维化和肝硬化的影像诊断和功能评估。综合影像学方法对器官移植术前后的评估。肿瘤综合介入治疗，包括肝癌及其伴随症状如门静脉癌栓，以及胰腺癌和肺癌的专项治疗。利用金属内支架和碘-125核素粒子条技术，对肿瘤性血管和恶性胆管梗阻进行靶向治疗。肿瘤局部射频或微波技术治疗，同时对门静脉高压和血栓进行精确介入治疗。微创治疗甲状腺和乳腺结节，以及血管狭窄或大血管疾病的腔内治疗。肝肿瘤及其他脏器肿瘤的超声早期精准诊断及疗效预测。肝纤维化、脂肪肝等弥漫性肝病的超声精准定量评估。超声微创治疗及疗效评估的超声系列研究。器官移植超声研究。血管病变超声研究。肝肿瘤及其他脏器肿瘤超声造影、超声弹性、超声AI等技术创新应用研究心脏瓣膜病的超声影像智能分析和诊断。超声心动图新技术在结构性心脏病导管介入和外科微创治疗、精准定量心功能中的应用。瘤核医学包含全方位的肿瘤诊断与治疗，专攻神经内分泌和骨转移肿瘤。心脏核医学专注于心血管疾病显像及心肌灌注与代谢功能的评估。神经系统核医学致力于脑肿瘤、脑血管疾病、癫痫和阿尔茨海默病等的诊断。技术创新与研发，从甲状腺疾病的放射治疗到PET/CT和SPECT/CT在多疾病诊断的应用，以及药代动力学研究和核医学设备与软件的开发和临床验证。胸部疾病的AI辅助诊断；肺结节的AI与组学分析，肺肿瘤病理学分型与肺门纵隔淋巴结转移的预测；新型冠状病毒性心肌炎的MRI研究等。

历年来，获得多项国家和省部级科研成果奖，获奖级别和次数在国内该领域首屈一指，包括：2021年度国家科技进步奖。另外，还获得全国中华医学科技进步二等奖2项；上海市科技进步一等奖3项，二等奖3项，三等奖6项。2001年，本学科所属的“影像医学与核医学”被评为国家教育部重点学科，211工程重点学科，复旦大学“985”重点建设学科；2007年再次被评为国家教育部重点学科，2013年入选国家卫计委“影像医学”重点专科建设项目，上海市“重中之重”建设专科。影研所在国内的综合业务水平处于国内领先地位，其中肝癌的影像诊断和介入治疗部分项目处于国际先进水平。进入新时代，影研所的不同学科之间交叉联合攻关，取得了一定成效。